Masalah utama yang diutarakan berkenaan dasar ini ialah nasih para pegawai kerajaan selepas kontrak lima tahun tamat memandangkan tiada dasar yang jelas bagi penyerapan para pegawai perubatan menjadi pegawai yang tetap.[3] Berdasarkan kenyataan oleh Menteri Kesihatan Adham Baba pada Mei 2021, hanya kira-kira 3% (789 orang) pegawai perubatan kontrak yang berjaya dilantik sebagai pegawai perubatan tetap daripada kira-kira 32 ribu orang pegawai terlibat.[3] Selain itu, beberapa lagi isu turut diutarakan termasuk gaji yang tidak setimpal, masalah cuti pekerja dan peluang melanjutkan pelajaran untuk menjadi pakar perubatan khusus.[13]

Kesan utama dasar pelantikan sebegini ialah ancaman pengurangan pegawai kesihatan negara. Hal ini ketara bagi para pelajar jurusan perubatan luar negara yang lebih berkeputusan untuk menyambung pelajaran di negara luar berbanding di Malaysia akibat ketidaktentuan yang terbit daripada dasar ini.[14] Masalah kekurangan doktor pakar di Malaysia juga menjadi ancaman yang diperkatakan dalam isu dasar ini.[15]

Dengan itu, penyerapan pegawai berkontrak secara automatik merupakan kaedah yang paling lazim yang diutarakan oleh pelbagai pihak sebagai alternatif dasar ini.[16] Walau bagaimanapun, kos pegurusan pegawai perubatan dijangka menjadi kekangan buat kerajaan dengan jangkaan kos dijangka meningkat daripada RM1.9 bilion (2019) ke RM2 bilion setahun apabila penyerapan automatik dilaksanakan. Sungguhpun begitu, para pakar menyatakan bahawa ini dapat diselesaikan dengan meningkatkan belanjawan terhadap sektor kesihatan secara am.[17]